College Football USA 96 possui ação de futebol americano universitário com 108 equipes da Divisão 1-A completas com listagens de 45 escalações para cada equipe. Possui os modos de jogo padrão, incluindo Exibição e Temporada, juntamente com a capacidade de jogar nos quatro Major Bowl (Rose, Orange, Fiesta & Sugar) em um esforço para ganhar o Campeonato Nacional. A jogabilidade é praticamente idêntica a muitos de seus competidores, passes, corridas, equipes especiais, etc. Também apresenta uma janela de 5 receptores na parte superior da tela quando o jogador passa para o modo de passe para visualizar todos os receptores disponíveis ao mesmo tempo. As estatísticas do jogador e da equipe estavam atualizadas na época e apresentavam partidas clássicas de futebol americano, tais como o Hail Mary e o Wishbone.