A guerra de 1999 deixou o país de Kookistan em frangalhos. Naturalmente, um ditador chamado General Akhboob assumiu o controle da nação sitiada e começou a criar um exército de mutantes radioativos. Com uma fortaleza praticamente impenetrável, um bando de reféns e uma legião de mutantes sob seu comando, o déspota do mal não se detém em nada além da dominação mundial. Apenas dois homens têm a coragem e a ingenuidade idealista de enfrentar Akhboob e suas forças: Capitão Carnage e Major Mayhem, também conhecido como Esquadrão do Juízo Final. Como capitão Carnage ou Major Mayhem, cabe a você ou a um amigo (em ação simultânea) resgatar os reféns enquanto atira em centenas de mutantes empenhados em sua destruição. Enquanto você caminha e corre para frente, para trás, esquerda, direita e diagonalmente através de 20 zonas de batalha sem parar, você sempre terá sua metralhadora ao seu lado. Armas adicionais que você pode encontrar ao longo do caminho incluem lançadores de granadas, lançadores de foguetes, metralhadoras de plasma, lança-chamas, rifles de fogo, lâminas defensivas e uma variedade de bombas.